mapnik не назойливо требует boost 1.41 и выше.
Далее идёт на сайт буста качаем свежую версию распаковываем, заходим в
cd /tools/jam/src
$ chmod u+x build.sh
$ ./build.sh
$ chmod u+x build.sh
$ ./build.sh
переходим в верх каталога и приступаем к сборке
tools/jam/src/bin.linuxx86/bjam --without-mpi stage --build-type=complete --layout=versioned
Минут на 30-40 можно идти курить.
Как всё скомпилится, можно и установить 
tools/jam/src/bin.linuxx86/bjam --without-mpi install